No dia 26 de Novembro de 2024, às 16h, aconteceu a defesa do Trabalho de Conclusão de Curso “Abordagem computacional para análise de dados de sequenciamento de RNA de células únicas em retinoblastoma” realizado pela aluna Maria Bruna Pilotto. Participaram da banca o professor Wilson Araújo da Silva Jr. (orientador), e os membros titulares, Geraldo Aleixo Passos e Rodrigo Jorge.
Link da defesa: https://www.youtube.com/live/thHLd-d9aLo?si=T-EY2–zWUVdTeRq
Segue o resumo do TCC:
“A análise de RNA de células únicas permite estudar o transcriptoma de células individuais, revelando variações na expressão gênica ao nível celular. Por conta disso, essa abordagem é amplamente utilizada no estudo dos mecanismos moleculares que regulam a progressão tumoral. Nesse contexto, analisamos dados públicos de transcriptoma de células únicas de retinoblastoma, considerado o tumor ocular primário mais comum da infância, para buscar um melhor entendimento da heterogeneidade do tumor. Para o processamento dos dados, foi construída uma pipeline em Nextflow que inclui etapas de alinhamento, controle de qualidade, análise de expressão gênica diferencial, caracterização de tipos celulares, enriquecimento de vias, inferência de trajetória e identificação de RNAs longos não
codificantes (lncRNAs). Após essa etapa, as células foram classificadas em diferentes tipos celulares, incluindo fibroblastos associados ao câncer (CAFs), células progenitoras, células de retinoblastoma, células T e células NK. A partir da identificação dos genes marcadores de cada tipo celular, foram encontrados genes
que podem estar associados ao prognóstico e desenvolvimento do tumor. A análise de enriquecimento funcional destacou que células de retinoblastoma e progenitoras têm vias associadas ao ciclo celular, enquanto os CAFs mostram enriquecimento em funções de resposta imune e adesão celular, sugerindo seu papel na metástase e suporte tumoral. A inferência de trajetória mostrou uma possível progressão das células progenitoras para células de retinoblastoma, apontando para um caminho de diferenciação que pode estar envolvido no desenvolvimento do tumor. Finalmente, a identificação dos lncRNAs ainda pouco explorados no contexto do retinoblastoma sugere novos candidatos para caracterização funcional. Estes achados contribuem para a compreensão dos mecanismos moleculares associados ao retinoblastoma e identificam potenciais alvos terapêuticos, fornecendo informações importantes para o desenvolvimento de diferentes estratégias de tratamento.”